Bagong Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
New Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit
(Flumineralscent RT-PCR Probe Method) Product Manual
【Product name 】Bagong Coronavirus(SARS-Cov-2) Nucleic Acid Detection Kit(Fluorescent RT-PCR Probe Method)
【Packaging specifications 】25 Mga Pagsusulit/Kit
【Intended usedad】
Ang kit na ito ay ginagamit para sa qualitative detection ng nucleic acid mula sa bagong coronavirus sa nasopharyngeal swabs, oropharyngeal (throat) swabs, anterior nasal swabs, mid-turbinate swabs, nasal wash at nasal aspirates mula sa mga indibidwal na pinaghihinalaang may COVID19 ng kanilang healthcare provider. Ang pagtuklas ng ORF1ab at N genes ng bagong coronavirus ay maaaring gamitin para sa pantulong na pagsusuri at epidemiological na pagsubaybay ng bagong impeksyon sa coronavirus.
【Principles of the procedure 】
Idinisenyo ang kit na ito para sa mga partikular na TaqMan probe at mga partikular na primer na idinisenyo para sa novel coronavirus (SARS-Cov-2) ORF1ab at N gene sequence. Ang PCR reaction solution ay naglalaman ng 3 set ng mga partikular na primer at fluorescent probe para sa partikular na pagtuklas ng mga target, at isang karagdagang hanay ng mga partikular na primer at fluorescent probe ang ginagamit bilang panloob na standard na kontrol ng kit para sa pag-detect ng endogenous housekeeping genes.
Ang prinsipyo ng pagsubok ay ang tiyak na fluorescent probe ay natutunaw at nagpapasama sa aktibidad ng exonuclease ng Taq enzyme sa reaksyon ng PCR, upang ang reporter fluorescent group at ang quenched fluorescent group ay magkahiwalay, upang ang fluorescence monitoring system ay makatanggap ng fluorescent signal, at pagkatapos ay Sa pamamagitan ng enrichment effect ng PCR amplification, ang fluorescence signal ng probe ay umabot sa isang set threshold value-Ct value (Cycle threshold). Sa kaso ng walang target na amplicon, ang reporter group ng probe ay malapit sa quenching group. Sa oras na ito, nangyayari ang paglipat ng enerhiya ng fluorescence resonance, at ang fluorescence ng reporter group ay pinapatay ng quenching group, upang ang fluorescent signal ay hindi matukoy ng fluorescent PCR instrument.
Upang masubaybayan ang paggamit ng mga reagents sa panahon ng pagsubok, ang kit ay nilagyan ng positibo at negatibong mga kontrol: ang positibong kontrol ay naglalaman ng target na site na recombinant plasmid, at ang negatibong kontrol ay Distilled water, na ginagamit upang subaybayan ang polusyon sa kapaligiran. Inirerekomenda na magtakda ng positibong kontrol at negatibong kontrol nang sabay-sabay kapag sumusubok.
【Main components 】
Cat. No. | BST-SARS-25 | BST-SARS-DR-25 | Components | |
Name | Specpagpapatibay | Damiito | Damiito | |
Positibong kontrol | 180 μL/vial | 1 | 1 | Mga plasmid na gawa sa artipisyal, Distilled water |
Negatibong kontrol | 180 μL/vial | 1 | 1 | Distilled water |
Halo ng SARS-Cov-2 | 358.5 μL/vial | 1 | / | Mga partikular na pares ng panimulang aklat, partikular na detection fluorescent probe, dNTP, , MgCl2, KCl, Tris-Hcl, Distilled water, atbp |
Paghalo ng Enzyme | 16.5 μL/vial | 1 | / | Taq enzymes, reverse transcriptase, UNG enzymes, atbp. |
SARS-Cov-2 Mix(Lyophilised) | 25 mga pagsubok / vial | / | 1 | Mga partikular na pares ng panimulang aklat, partikular na detection fluorescent probe, dNTP, Taq enzymes, reverse transcriptase, Distilled water, atbp. |
2x Buffer | 375 μL/vial | / | 1 | MgCl2, KCl, Tris-Hcl, Distilled water, atbp. |
Tandaan:( 1) Ang mga bahagi sa iba't ibang batch kit ay hindi maaaring ihalo o palitan.
(2) Maghanda ng sarili mong reagent: Nucleic acid extraction kit.
【Storage conditions at expiration date 】
For BST-SARS-25:Magdala at mag-imbak sa -20±5℃ sa mahabang panahon.
For BST-SARS-DR-25:Transport sa temperatura ng kuwarto. Mag-imbak sa -20±5 ℃ nang mahabang panahon.
Iwasan ang paulit-ulit na freeze-thaw cycle. Ang panahon ng bisa ay pansamantalang itinakda para sa 12 buwan.
Tingnan ang label para sa petsa ng paggawa at paggamit.
Pagkatapos ng unang pagbubukas, ang reagent ay maaaring maimbak sa -20±5 ° C nang hindi hihigit sa 1 buwan o hanggang sa katapusan ng panahon ng reagent, alinman ang petsa ang mauna, upang maiwasan ang paulit-ulit na freeze-thaw cycle, at ang bilang ng reagent freeze -Ang mga siklo ng pagtunaw ay hindi dapat lumampas sa 6 na beses.
【Applicable instrument】ABI 7500, SLAN-96P, Roche-LightCycler-480.
【Sample requirements 】
1. Naaangkop na uri ng sample: Extracted nucleic acid solution.
2. Sample na imbakan at transportasyon: Mag-imbak sa-20±5℃ sa loob ng 6 na buwan. I-freeze at lasawin ang mga sample nang hindi hihigit sa 6 na beses.
【Testing method】
1.Nucleic acid extraction
Pumili ng angkop na kit ng pagkuha ng nucleic acid upang kunin ang viral nucleic acid, at sundin ang kaukulang mga tagubilin sa kit. Inirerekomendang gumamit ng Nucleic acid extraction at purification kit na ginawa ng Yixin Bio-Tech (Guangzhou) Co., Ltd. o katumbas na nucleic acid purification kit.
2. Reaction reagent preparation
2.1 For BST-SARS-25:
( 1) Alisin ang SARS-Cov-2 Mix at Enzyme Mix , ganap na matunaw sa temperatura ng silid na ihalo nang lubusan sa pamamagitan ng Vortex device at pagkatapos ay i-centrifuge saglit.
(2) Ang 16.5uL Enzyme Mix ay idinagdag sa 358.5uL SARS-Cov-2 Mix at pinaghalo nang maigi upang makuha ang pinaghalong solusyon sa reaksyon.
(3) Maghanda ng malinis na 0.2 mL PCR octal tube at markahan ito ng 15uL ng nasa itaas na mixed reaction solution sa bawat balon.
(4) Magdagdag ng 15 μL ng purified nucleic acid solution, ang positibong kontrol at ang negatibong kontrol, at maingat na takpan ang octal tube cap.
(5) Haluing mabuti sa pamamagitan ng pagbaligtad, at mabilis na i-centrifuge upang mai-concentrate ang likido sa ilalim ng tubo.
1
2.2 For BST-SARS-DR-25:
( 1) Magdagdag ng 375ul 2x Buffer sa SARS-Cov-2 Mix((Lyophilised) para ihanda ang reaction mix. Haluing maigi sa pamamagitan ng pipetting at pagkatapos ay i-centrifuge saglit. (Kapag handa na ang reaction mix, inirerekumenda na mag-imbak sa -20℃ sa pangmatagalang imbakan.)
(2) Maghanda ng malinis na 0.2 mL PCR octal tube at markahan ito ng 15μL ng reaction mix bawat balon.
(3) Magdagdag ng 15μL ng purified nucleic acid solution, ang positive control at ang negative control, at maingat na takpan ang octal tube cap.
(4) Haluing mabuti sa pamamagitan ng pagbaligtad, at mabilis na i-centrifuge upang mai-concentrate ang likido sa ilalim ng tubo.
3. PCR amplification (Mangyaring sumangguni sa manu-manong instrumento para sa mga setting ng pagpapatakbo.)
3. 1 Ilagay ang PCR 8-tube sa sample chamber ng fluorescent PCR instrument, at itakda ang sample na susuriin, ang positive control at ang negative control ayon sa pagkakasunud-sunod ng loading.
3.2 Channel ng pagtuklas ng fluorescence:
( 1) Pinipili ng ORF1ab gene ang detection channel ng FAM (Reporter: FAM, Quencher: Wala).
(2) Pinipili ng N gene ang detection channel ng VIC (Reporter: VIC, Quencher: Wala).
(3) Pinipili ng internal standard gene ang detection channel ng CY5 (Reporter: CY5, Quencher: Wala).
(4) Ang Passive Reference ay nakatakda sa ROX.
3.3 Setting ng parameter ng PCR program:
Hakbang | Temperatura(℃) | Oras | Bilang ng mga cycle | |
1 | Reverse transcription reaction | 50 | 15 min | 1 |
2 | Pag-activate ng Taq enzyme | 95 | 2.5 min | 1 |
3 | Pag-activate ng Taq enzyme | 93 | 10 s | 43 |
Extension ng pagsusubo at pagkuha ng fluorescence | 55 | 30 s |
Pagkatapos ng setting, i-save ang file at patakbuhin ang reaction program..
4.Results analysis
Pagkatapos ng programa, ang mga resulta ay awtomatikong nai-save, at ang amplification curve ay nasuri. Ang amplification curve ay nakatakda sa default na threshold ng instrumento.
【Explanation of test results 】
1. Tukuyin ang validity ng eksperimento: Ang positibong control FAM, VIC channel ay dapat na may tipikal na amplification curve, at ang Ct value ay karaniwang mas mababa sa 34, ngunit maaaring magbago dahil sa iba't ibang threshold setting ng iba't ibang instrumento. Ang negatibong kontrol na FAM, VIC channel ay dapat na hindi pinalakas na Ct. Napagkasunduan na ang mga kinakailangan sa itaas ay dapat matugunan nang sabay-sabay, kung hindi, ang pagsusulit na ito ay hindi wasto.
2. Resulta ng paghatol
FAM/VIC channel | Resulta ng paghatol |
Ct<37 | Positibo ang sample test |
37≤Ct<40 | Ang amplification curve ay hugis-S, at ang mga kahina-hinalang sample ay kailangang muling suriin; kung ang mga resulta ng muling pagsusuri ay pare-pareho, ito ay hinuhusgahan bilang positibo, kung hindi, ito ay negatibo |
Ct≥40 O Walang Amplification | Negatibo ang sample na pagsusuri (o mas mababa sa mas mababang limitasyon ng pag-detect ng kit) |
Tandaan: ( 1) Kung ang FAM channel at ang VIC channel ay positibo sa parehong oras, ang SARS-Cov-2 ay tinutukoy na positibo.
(2) Kung ang FAM channel o VIC channel ay positibo at ang kabilang channel ay negatibo, ang pagsubok ay dapat na ulitin. Kung ito ay positibo sa parehong oras, ito ay huhusgahan bilang SARS-Cov-2 positibo, kung hindi, ito ay huhusgahan bilang SARS-Cov-2 negatibo.